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2008/11/27

homolog, ortholog, and paralog

這啥?

是的,這啥?每回在 paper 上看到 homolog/ortholog/paralog 等等的字時,就會開始在腦中尋找它們的定義。可惜,總沒記得住,以至於情況就陷入像是在『自己/已經』的字詞中,選擇『已/己/巳』三字裡的正確單字——我是用行列輸入法打字的,所以有這種情況出現。

今天,學長走來問我相關用法,而我又不是很確定。於是再次請教 google 大神,看看正確用法是什麼。簡單來說,homolog 是一般我們說的同源基因,也就是基因間有「血源關係」的意思。而 ortholog 呢?它是指『不同物種』間的基因,有源於共同祖源基因的關係,通常基因功能一樣,但又因為演化的緣故,使得在比較兩個 ortholog genes 間的功能時,會發現其中一個有 lost-of-function 或是 gain-of-function 的現象。最後一個單字,paralog 則是指基因間是由於 gene duplication 而來的,是『一個物種』內 genome 的複製產物,最後也有可能會演化出不太一樣的功能,但有時候其中一份會是 pseudogene。有幾個網站上的說明可以參考:參考資料一參考資料二

以下是一個簡圖,免得自已忘記。圖中是以 globin 為例:







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12 則留言:

  1. 不用客氣。
    也歡迎您的分享。

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  2. 真的很感謝
    幫了我大忙啊
    最近也在看paper
    看得頭昏腦脹..

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  3. 真的很感謝~~~好清楚^^thank you very much

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  4. 讀普生時用到了~~多謝

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  5. 謝謝 正好在苦惱!!

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  6. 感謝你!!!!

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  7. 很清楚易懂,感謝分享~

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